Programim dhe zhvillim, javascript, python, php, html

Baza e të dhënave e integruar Neo4j hedh permgen dhe OutOfMemoryError kur fillon

Unë jam duke përdorur Spring Data Neo4j 3.2.0 dhe Neo4j 2.1.2.

Po përdor Gradle si mjetin tim të ndërtimit dhe po e nis aplikacionin në zhvillim duke përdorur shtojcën gradle tomcat. Për ditë të tëra kjo funksionoi mirë.

Tani në ditën e kaluar, po filloj të marr gabime në kujtesë kur nis aplikacionin. Ndonjëherë gabimet nuk ndodhin derisa të kryej një pyetje, por herë pas here marr gabime në kujtesë vetëm në fillim.

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "main"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "qtp1102557897-37"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "qtp1102557897-36"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "HashSessionScavenger-0"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "qtp1102557897-38"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "qtp1102557897-39"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "qtp1102557897-40"

Exception: java.lang.OutOfMemoryError thrown from the UncaughtExceptionHandler in thread "RMI RenewClean-[10.30.65.86:51134]"

Si po e nis serverin e integruar:

public EmbeddedGraphDatabase createEmbeddedDatabase(String storeDir) {
        return (EmbeddedGraphDatabase) new GraphDatabaseFactory()
                .newEmbeddedDatabaseBuilder( storeDir )
                .setConfig(GraphDatabaseSettings.allow_store_upgrade, "true")
                .setConfig(ShellSettings.remote_shell_enabled, "true")
                .newGraphDatabase();

Gradle po fillon me konfigurimin standard që duket si ky pasi të funksionojë:

java -Xmx512m -classpath /Users/rwalls/Development/gradle-1.12/lib/gradle-launcher-1.12.jar org.gradle.launcher.GradleMain tomcatRunWar

Madhësitë e skedarëve të ruajtur:

{
    "description": "Information about the sizes of the different parts of the Neo4j graph store",
    "name": "org.neo4j:instance=kernel#0,name=Store file sizes",
    "attributes": [
      {
        "description": "The total disk space used by this Neo4j instance, in bytes.",
        "name": "TotalStoreSize",
        "value": 291941310,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used by the current Neo4j logical log, in bytes.",
        "name": "LogicalLogSize",
        "value": 184,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used to store array properties, in bytes.",
        "name": "ArrayStoreSize",
        "value": 128,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used to store nodes, in bytes.",
        "name": "NodeStoreSize",
        "value": 4341060,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used to store properties (excluding string values and array values), in bytes.",
        "name": "PropertyStoreSize",
        "value": 16972278,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used to store relationships, in bytes.",
        "name": "RelationshipStoreSize",
        "value": 39276426,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "The amount of disk space used to store string properties, in bytes.",
        "name": "StringStoreSize",
        "value": 1476352,
        "isReadable": "true",
        "type": "long",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      }
    ],
    "url": "org.neo4j/instance%3Dkernel%230%2Cname%3DStore+file+sizes"
  }

Konfigurimi i serverit (i cili duket se varet nga fillimi):

{
    "description": "The configuration parameters used to configure Neo4j",
    "name": "org.neo4j:instance=kernel#0,name=Configuration",
    "attributes": [
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "store_dir",
        "value": "/Users/rwalls/Development/neo4j-community-2.1.2/data/graph.db",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "neostore.nodestore.db.mapped_memory",
        "value": "460M",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Enable a remote shell server which shell clients can log in to",
        "name": "remote_shell_enabled",
        "value": "true",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "ephemeral",
        "value": "false",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "neostore.propertystore.db.strings.mapped_memory",
        "value": "1408M",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "neostore.propertystore.db.arrays.mapped_memory",
        "value": "1596M",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "allow_store_upgrade",
        "value": "true",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "neostore.relationshipstore.db.mapped_memory",
        "value": "2031M",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      },
      {
        "description": "Configuration attribute",
        "name": "neostore.propertystore.db.mapped_memory",
        "value": "1657M",
        "isReadable": "true",
        "type": "java.lang.String",
        "isWriteable": "false ",
        "isIs": "false "
      }
    ],
    "url": "org.neo4j/instance%3Dkernel%230%2Cname%3DConfiguration"
  }

E kuptoj se mund ta nisja java-n me më shumë memorie të alokuar... por e provova atë me shumë opsione të ndryshme dhe përsëri kisha gabime.

Idetë?

Hapi im tjetër është të ekzekutoj aplikacionin në një shembull standard tomcat (në vend të nga gradle) për të parë nëse kjo bën një ndryshim.

EDIT

Gjurma e stivës:

Caused by: java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space
    at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)
    at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)
    at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:142)
    at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:449)
    at java.net.URLClassLoader.access$100(URLClassLoader.java:71)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:361)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
    at org.gradle.internal.classloader.MultiParentClassLoader.loadClass(MultiParentClassLoader.java:63)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at org.gradle.internal.classloader.CachingClassLoader.loadClass(CachingClassLoader.java:41)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at org.gradle.internal.classloader.FilteringClassLoader.loadClass(FilteringClassLoader.java:80)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at org.gradle.internal.classloader.CachingClassLoader.loadClass(CachingClassLoader.java:41)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
    at org.apache.tools.ant.AntClassLoader.findBaseClass(AntClassLoader.java:1385)
    at org.apache.tools.ant.AntClassLoader.loadClass(AntClassLoader.java:1080)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:412)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.loadClass(PackagingDataCalculator.java:202)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.bestEffortLoadClass(PackagingDataCalculator.java:221)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.computeBySTEP(PackagingDataCalculator.java:136)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.populateUncommonFrames(PackagingDataCalculator.java:111)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.populateFrames(PackagingDataCalculator.java:103)
    at ch.qos.logback.classic.spi.PackagingDataCalculator.calculate(PackagingDataCalculator.java:55)

Pastebin i mesazheve.log: http://pastebin.com/uD8KnpaX Pastebin i threaddump: http://pastebin.com/ipXwH7Vc


  • A e keni në dispozicion stacktrace të plotë? A mund të ndani gjithashtu skedarin e regjistrit neo4j graph.db/messages.log? Dhe ndoshta krijoni një threaddump me jstack (i cili gjithashtu përfshin informacione të grumbullit) kur ndodhin ato gabime. 14.10.2014
  • @MichaelHunger Përditësova përgjigjen time me informacionin që dëshironit. Faleminderit! 15.10.2014

Përgjigjet:


1

E shtoi këtë rresht te gradle.properties

org.gradle.jvmargs=-XX:+UseConcMarkSweepGC -Xmx2048m -Xms512m -server -XX:MaxPermSize=512M

Dhe duket se e ka zgjidhur problemin.

Përpjekjet e mia të mëparshme dështuan sepse po përditësoja GRADLE_OPTS, e cila me sa duket nuk i kalon ndryshimet e kujtesës në shembullin e krijuar nga tomcat.

14.10.2014
Materiale të reja

Masterclass Coroutines: Kapitulli-3: Anulimi i korutinave dhe trajtimi i përjashtimeve.
Mirë se vini në udhëzuesin gjithëpërfshirës mbi Kotlin Coroutines! Në këtë seri artikujsh, unë do t'ju çoj në një udhëtim magjepsës, duke filluar nga bazat dhe gradualisht duke u thelluar në..

Faketojeni derisa ta arrini me të dhënat false
A e gjeni ndonjëherë veten duke ndërtuar një aplikacion të ri dhe keni nevojë për të dhëna testimi që duken dhe duken më realiste ose një grup i madh të dhënash për performancën e ngarkesës...

Si të përdorni kërkesën API në Python
Kërkesë API në GitHub për të marrë depot e përdoruesve duke përdorur Python. Në këtë artikull, unë shpjegoj procesin hap pas hapi për të trajtuar një kërkesë API për të marrë të dhëna nga..

Një udhëzues hap pas hapi për të zotëruar React
Në këtë artikull, do të mësoni se si të krijoni aplikacionin React, do të mësoni se si funksionon React dhe konceptet thelbësore që duhet të dini për të ndërtuar aplikacione React. Learning..

AI dhe Psikologjia — Pjesa 2
Në pjesën 2 të serisë sonë të AI dhe Psikologji ne diskutojmë se si makineritë mbledhin dhe përpunojnë të dhëna për të mësuar emocione dhe ndjenja të ndryshme në mendjen e njeriut, duke ndihmuar..

Esencialet e punës ditore të kodit tim VS
Shtesat e mia të preferuara - Git Graph 💹 Kjo shtesë është vërtet e mahnitshme, e përdor përpara se të filloj të punoj për të kontrolluar dy herë ndryshimet dhe degët më të fundit, mund të..

Pse Python? Zbulimi i fuqisë së gjithanshme të një gjiganti programues
Në peizazhin gjithnjë në zhvillim të gjuhëve të programimit, Python është shfaqur si një forcë dominuese. Rritja e tij meteorike nuk është rastësi. Joshja e Python qëndron në thjeshtësinë,..